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NGS各种组学建库原理(图解)

pythonic生物人 pythonic生物人 2022-09-11

"pythonic生物人"的第61篇分享

本文分享NGS中各种组学建库原理图【llumina官,分三个方向:Seq—DNA(DNA层面)、Seq—RNA(RNA层面)、Seq—Single-Cell(单细胞层面)。

本文将了解到什么?

1、DNA层面各组学建库原理图解:Seq—DNADNA variantsLow levels of DNAEpigeneticsDNA–protein interactionsProtein–protein interactions
2、RNA层面各组学建库原理图解:Seq—RNARNA transcriptionRNA–protein interactionsLow levels of RNARNA modificationsRNA structure
3、单细胞层面各组学建库原理图解:Seq—Single-CellLow-level RNA detectionLow-level DNA detectionIntegrated DNA and RNA analysis

正文开始啦

1、DNA层面:Seq—DNA

具体分如下几个方向

  • DNA variants
  • Low levels of DNA
  • Epigenetics

CAB-Seq

  • DNA–protein interactions

ChIP-Seq

ATAC-SeqHi-C 、3-C

  • Protein–protein interactions

2、RNA层面:Seq—RNA

分以下几类:

  • RNA transcription
  • RNA–protein interactions
  • Low levels of RNA

UMI Method

  • RNA modifications
  • RNA structure

3、单细胞层面:Seq—Single-Cell

可分以下几个方面:

  • Low-level RNA detection

  • Low-level DNA detection
  • Integrated DNA and RNA analysis
https://www.illumina.com/


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